《奇异博士2》预告中出现了疑似“黑奇异”的奇异法师官方名为叫做“邪恶奇异”，而影片的主要反派这是猩红女巫旺达。电影中旺达受到黑暗神书的影响出现精神错乱认为自己的两个孩子遗失在多元宇宙，自己无奈你能用灵体穿越多元宇宙寻找自己的孩子。在得知“美国小姐”艾美莉卡可以自由打开星星传送门后便召唤眼魔之类的怪兽去抓获美国小姐。

艾美莉卡为了躲避追击逃到了MCU，在主世界里奇异博士正在参加老相好克里斯汀的婚礼撞见了正在被追杀的艾美莉卡并发现旺达已经黑化；奇异博士决定在公园找旺达谈谈。 在交谈未果后奇异博士只好把艾美莉卡带回卡玛泰姬魔法学院。

黑化了的旺达袭击卡玛泰姬学院，奇异博士不敌只能带着艾美莉卡且战且退不停穿梭多元宇宙躲避，其中还出现了漫画中的“蛮荒大陆”、卡通维度等多元维度十分奇异。在穿越中奇异博士碰到了平行宇宙的莫度男爵被对方带到有X教授的光照会，艾美莉卡被囚禁了起来、奇异博士被一群机器人押解疑似钢铁侠会出现在电影中由阿汤哥扮演。

其他光照会成员：神奇先生将由约翰卡拉辛斯基扮演。海王纳摩由特诺切韦尔塔扮演，同时平行宇宙的莫度男爵也属于光照会，而X教授则是熟悉的斯图尔特扮演。而主宇宙的旺达操纵该平行世界的红女巫攻击平行宇宙的惊奇队长，强势攻破光照会幸好被X教授的心灵感应牵制。

电影故事的最后主世界的旺达如愿见到了自己的“孩子”，她这时才意识到自己的孩子从未身处险境直到自己的到来。在旺达消失时她的一个举动影响了整个多元宇宙，等奇异博士和艾美莉卡重回主宇宙发现多元宇宙并没有恢复正常反而变得更加动荡。

除了主故事线剧情还有“丧尸”版奇异博士，平行宇宙中的捍卫者在超级碗预告中丧尸复活化。